Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1Q969G3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms