Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPPL3Q8TCT6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPPL3Q8TCT6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms