Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELBQ8NG08 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELBQ8NG08 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms