Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDPRQ8NCN5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDPRQ8NCN5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms