Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPC24Q8NBT2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPC24Q8NBT2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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