Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAAF3Q8N9W5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms