Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSL3Q8N5Y2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms