Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCE1Q8N0S2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCE1Q8N0S2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms