Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF13Q86YI8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF13Q86YI8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms