Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00523Q86TU6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00523Q86TU6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms