Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG4DQ86TL0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG4DQ86TL0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms