Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYDE1Q6ZW31 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms