Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCBE1Q6UXH8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms