Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BLOC1S2Q6QNY1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BLOC1S2Q6QNY1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms