Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASC4Q6P4E1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASC4Q6P4E1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASC4Q6P4E1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASC4Q6P4E1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASC4Q6P4E1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASC4Q6P4E1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASC4Q6P4E1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms