Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EDC4Q6P2E9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms