Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF40BQ6NWY9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRPF40BQ6NWY9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms