Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEPROQ6NW34 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms