Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCTD16Q68DU8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms