Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
WDR78Q5VTH9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WDR78Q5VTH9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WDR78Q5VTH9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms