Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC183Q5T5S1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC183Q5T5S1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC183Q5T5S1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms