Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TDRD12Q587J7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TDRD12Q587J7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms