Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C4orf46Q504U0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms