Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SP6Q3SY56 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SP6Q3SY56 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms