Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL38Q2WGJ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL38Q2WGJ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms