Protein–RNA interactions for Protein: Q16678

CYP1B1, Cytochrome P450 1B1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1B1Q16678 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CYP1B1Q16678 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CYP1B1Q16678 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms