Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTF1Q16619 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTF1Q16619 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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