Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F4Q16254 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E2F4Q16254 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E2F4Q16254 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms