Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NPTX1Q15818 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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