Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SEC23BQ15437 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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SEC23BQ15437 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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SEC23BQ15437 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC23BQ15437 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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