Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CNN3Q15417 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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