Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)21.82■■□□□ 1.086e-8■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)19.62■□□□□ 0.736e-8■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 NPRL3-210ENST00000610509 2917 ntTSL 212.82□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.151e-9■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.731e-9■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.651e-9■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-9■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-9■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SERPINB6-203ENST00000380524 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-9■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SERPINB6-205ENST00000380539 1338 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.831e-9■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.971e-9■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 BCAM-209ENST00000590624 991 ntTSL 1 (best)22■■□□□ 1.112e-13■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.142e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.992e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.752e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 NR1H2-203ENST00000593532 2380 ntTSL 217.75■□□□□ 0.432e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRRT-209ENST00000474896 726 ntTSL 317.39■□□□□ 0.372e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.238e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRRT-201ENST00000423692 727 ntTSL 516.43■□□□□ 0.222e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 SRRT-219ENST00000641476 992 nt16.23■□□□□ 0.192e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 WDR62-205ENST00000587391 5971 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.12e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.085e-13■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 TIMP1-204ENST00000445623 595 ntTSL 214.53□□□□□ -0.085e-13■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.085e-13■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-225ENST00000570513 553 ntTSL 412.57□□□□□ -0.48e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-202ENST00000372317 462 ntTSL 312.57□□□□□ -0.48e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-228ENST00000576582 575 ntTSL 511.97□□□□□ -0.498e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-10■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-206ENST00000503463 750 ntTSL 211.84□□□□□ -0.518e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-214ENST00000509415 558 ntTSL 411.84□□□□□ -0.518e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-227ENST00000575560 540 ntTSL 511.14□□□□□ -0.638e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-219ENST00000511697 558 ntTSL 410.98□□□□□ -0.658e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-203ENST00000416445 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.718e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-217ENST00000510356 1009 ntTSL 1 (best)9.21□□□□□ -0.948e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.948e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-215ENST00000509507 1512 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.998e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-221ENST00000513119 973 ntTSL 58.23□□□□□ -1.098e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.118e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.388e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 CALCOCO2-207ENST00000505071 495 ntTSL 55.59□□□□□ -1.518e-6■■■■□ 23.1
PCBP1Q15365 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.831e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 PNPLA2-204ENST00000529255 1301 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.714e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RPLP0-218ENST00000550856 1003 ntTSL 219.27■□□□□ 0.681e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 TMEM259-206ENST00000589055 791 ntTSL 317.68■□□□□ 0.423e-12■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RPLP0-226ENST00000552461 2591 ntTSL 216.29■□□□□ 0.21e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RPLP0-206ENST00000546990 770 ntTSL 315.9■□□□□ 0.141e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 TMEM259-212ENST00000607316 477 ntTSL 215.03■□□□□ -03e-12■■■■□ 23
PCBP1Q15365 TMEM259-203ENST00000586250 418 ntTSL 314.57□□□□□ -0.083e-12■■■■□ 23
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PCBP1Q15365 RPLP0-209ENST00000547211 781 ntTSL 313.46□□□□□ -0.251e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RPLP0-203ENST00000392514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RPLP0-214ENST00000549098 1106 ntTSL 212.37□□□□□ -0.431e-10■■■■□ 23
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PCBP1Q15365 RPLP0-221ENST00000551258 966 ntTSL 511.31□□□□□ -0.61e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RPLP0-213ENST00000548568 1127 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.611e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RPLP0-207ENST00000547173 864 ntTSL 39.24□□□□□ -0.931e-10■■■■□ 23
PCBP1Q15365 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.29e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 PKM-217ENST00000566809 560 ntTSL 422.38■■□□□ 1.173e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 PKM-218ENST00000567087 550 ntTSL 420.61■□□□□ 0.893e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 PKM-223ENST00000569050 457 ntTSL 418.8■□□□□ 0.63e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 PKM-211ENST00000564276 753 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.843e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 EIF4G1-229ENST00000457456 983 ntTSL 29.68□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 TIAL1-211ENST00000489822 2222 ntTSL 217.01■□□□□ 0.313e-11■■■■□ 23
PCBP1Q15365 TIAL1-213ENST00000497671 2321 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.013e-11■■■■□ 23
PCBP1Q15365 USF2-215ENST00000602164 582 ntTSL 329.71■■■□□ 2.352e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.612e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 USF2-210ENST00000598058 510 ntTSL 222.33■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 421.7■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 417.17■□□□□ 0.344e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.34e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 RAI1-202ENST00000395774 2928 ntTSL 216.41■□□□□ 0.224e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.224e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.074e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 315.37■□□□□ 0.054e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.154e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 23
PCBP1Q15365 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 23
PCBP1Q15365 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.715e-10■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 MLXIPL-210ENST00000476404 1921 ntTSL 217.37■□□□□ 0.371e-8■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.016e-8■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.016e-8■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.036e-8■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.066e-8■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.126e-8■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.236e-8■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.074e-7■■■■□ 22.9
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