Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB35Q15286 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms