Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CLCA4Q14CN2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CLCA4Q14CN2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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