Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CSHL1Q14406 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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