Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KRR1Q13601 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRR1Q13601 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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