Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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