Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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