Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3BQ13214 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3BQ13214 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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