Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF3Q13114 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF3Q13114 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms