Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TWF1Q12792 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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