Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBRQ0VD83 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBRQ0VD83 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms