Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DSC1Q08554 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSC1Q08554 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms