Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GOLGA3Q08378 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GOLGA3Q08378 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GOLGA3Q08378 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms