Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms