Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT1Q02742 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT1Q02742 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms