Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OC90Q02509 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OC90Q02509 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OC90Q02509 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OC90Q02509 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms