Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APBA1Q02410 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APBA1Q02410 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms