Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGD1P98174 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGD1P98174 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGD1P98174 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGD1P98174 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD1P98174 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD1P98174 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD1P98174 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD1P98174 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD1P98174 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD1P98174 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD1P98174 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD1P98174 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD1P98174 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD1P98174 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD1P98174 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms