Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CRB1P82279 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRB1P82279 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRB1P82279 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRB1P82279 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CRB1P82279 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRB1P82279 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRB1P82279 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CRB1P82279 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CRB1P82279 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CRB1P82279 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRB1P82279 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CRB1P82279 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CRB1P82279 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CRB1P82279 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CRB1P82279 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRB1P82279 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRB1P82279 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRB1P82279 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRB1P82279 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CRB1P82279 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRB1P82279 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRB1P82279 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRB1P82279 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRB1P82279 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRB1P82279 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CRB1P82279 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CRB1P82279 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRB1P82279 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRB1P82279 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRB1P82279 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CRB1P82279 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CRB1P82279 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms